La elaboración del Plan de Acción de Arequipa se inició en 1999 con la participación de las instituciones, sectores y personas involucradas con la problemática ambiental del departamento de Arequipa, orientados en base a la construcción de propuestas, acuerdos y compromisos para la acción y el desarrollo de una cultura de concertación.

El Plan de Acción Ambiental Regional identifica los principales problemas y los prioriza; además contiene la visión de la región al 2021 y la misión que debe tener la Comisión Ambiental Regional (CAR) de Arequipa.
Asimismo, se establecieron los objetivos priorizados, las líneas de acción y los indicadores por cada frente de acción.

Entre los objetivos identificados y prioritarios tenemos: la gestión sostenible de los recursos hídricos y suelos, la protección de la biodiversidad y los recursos genéticos, mejorar la calidad de aire en la ciudad de Arequipa, la gestión adecuada de los desechos sólidos, líquidos y gaseosos; la mejora de la conciencia, educación, y cultura ambiental en la población regional y el fortalecimiento de los espacios de concertación.